分子是一种构成物质的粒子，呈电中性、由一个或多个原子组成，原子之间因共价键而键结。能够单独存在、保持物质的化学性质；由分子组成的物质叫分子化合物。

一个分子是由多个原子在共价键中通过共用电子连接一起而形成。它可以由相同的化学元素构成，如氧气分子 O₂；也可以由不同的元素构成，如水分子 H₂O。若原子之间由非共价键的化学键（如离子键）所结合，一般不会视为是单一分子。

在不同的领域中，分子的定义也会有一点差异：在热力学中，构成物质的分子（如水分子）、原子（如碳原子）、离子（如氯离子）等在热力学上的表现性质都是一样的，因此，都统称为分子；在气体动力论中，分子是指任何构成气体的粒子，此定义下，单原子的惰性气体也可视为是分子。而在量子物理、有机化学及生物化学中，多原子的离子（如硫酸根）也可以视为是一个分子。

A molecule is an electrically neutral group of two or more atoms held together by chemical bonds. Molecules are distinguished from ions by their lack of electrical charge. However, in quantum physics, organic chemistry, and biochemistry, the term molecule is often used less strictly, also being applied to polyatomic ions.