蛋白核（Pyrenoid）系一类存在于许多藻类的载色体中和陆生的角藓门的叶绿体中的一类亚细胞结构。蛋白核与一种碳浓缩机制（CCM）有关。该结构主要作用是作为二氧化碳（CO₂）固定的中心，它能在与光合作用相关的加氧酶周围创造、维持一个高二氧化碳浓度环境。由此不难发现，蛋白核的作用和蓝细菌的羧酶体相似。

藻类只能生活在水环境中，即使是陆生的藻类也是如此——这限制了它们对二氧化碳的吸收。二氧化碳在水中的扩散速度比在空气中的慢10,000倍。另外，二氧化碳在水中浓度达到平衡也需要较长时间。因此，水中的二氧化碳很容易耗尽，水从空气中吸收二氧化碳的速度也很慢。另外，二氧化碳溶于水后会和水中的碳酸氢根达到平衡。这种平衡受到水中pH值的调控。比如，在海水中，溶解无机碳（DIC）主要以碳酸氢根的形式存在，游离的二氧化碳很少，在这种条件下，藻类加氧酶的工作速度甚至不能达到最快速度的四分之一。因此，二氧化碳浓度有时会成为限制藻类光合作用的因素之一。

Pyrenoids are sub-cellular micro-compartments found in chloroplasts of many algae, and in a single group of land plants, the hornworts. Pyrenoids are associated with the operation of a carbon-concentrating mechanism (CCM). Their main function is to act as centres of carbon dioxide (CO₂) fixation, by generating and maintaining a CO₂ rich environment around the photosynthetic enzyme ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase (Rubisco). Pyrenoids therefore seem to have a role analogous to that of carboxysomes in cyanobacteria.